Science:从基因表达层次解析为何“男女有别”

2022-01-31 00:47:50 来源:
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已有的深入研究推测,许多复杂的生命遗传,还包括癌症,都表现出同病态恋相异的特征。这些同病态恋相异被并不相同某种程度地看做雌血清素、病态染色体、蛋白质型×同病态恋物理现象、行为相异和周围环境暴露的相异。然而,至今为止,它们的有助于和必需生命体学原理在相当大某种程度上即使如此是难以确定的。

蛋白质型-有第三组织表达(GTEx)计划透过了一个机会,让我们可以通过深入研究许多以前未曾以这种作法密切相关的有第三组织,来探索生命核糖体第三组之中同病态恋相异的合理病态和基因有助于。

最近,深入研究管理人员在Science杂志发文。为了密切相关生命核糖体第三组及其转录的同病态恋相异,并发掘出同病态恋和基因学如何相互阻碍复杂的变异和癌症,深入研究管理人员在GTEx计划(v8数据公开发表)调查的44个生命有第三组织来源之中生成了蛋白质表达及其基因转录的同病态恋相异目录,并深入研究了16245个RNA基因第三组样本和838个成年群体的蛋白质型。

在此坚实上,深入研究管理人员报告了蛋白质表达水平、有第三组织细胞内类型第三组成和顺式表达定量变异肽链(cis-eQTLs)的同病态恋相异。为了评估它们的阻碍,深入研究管理人员将这些结果与87个GWAS的蛋白质功能、核糖体突变结合编者和全蛋白质第三组相似之处深入研究(GWAS)汇总统计学相结合。

结果推测,同病态恋对蛋白质表达的阻碍是无处不在的 (在所有有第三组织之中,深入研究管理人员检验了13 294个有同病态恋相异的蛋白质)。然而,这些阻碍很小,而且主要是有第三组织特异病态的。

具有同病态恋相异表达的蛋白质主要不是由有第三组织特异病态蛋白质表达飞轮的,而是参与了一系列专业化的生命体功能,如药物和血清素底物、脊椎动物和有第三组织形态牵涉到、受精卵、病态生殖和精子牵涉到、脂肪激素、癌症和免疫系统等。

而X连接蛋白质在女同病态恋之中表达较高,若有了免于X染色体失活的候选蛋白质,常染色体蛋白质的同病态恋偏重病态表达若有了与血清素相关的核糖体突变转录和额外核糖体突变的关键作用,以及密切相关基因学标记的同病态恋相异病态分布,值得注意是第三核酸H3 Lys27三甲基化(H3K27me3)。

蛋白质表达的基因转录的同病态恋相异要少得多(在所有有第三组织之中检验出了369个同病态恋偏重的eQTL),并且具有高度的有第三组织特异病态。深入研究管理人员发掘出了58个由单一同病态恋的蛋白质表达基因转录飞轮的蛋白质-变异相似之处。这些还包括同病态恋相异的细胞内类型原子量内源性蛋白质型-遗传相似之处的肽链,以及同病态恋意味著在相似之处的潜在小分子有助于之中充分发挥更加直接关键作用的肽链。例如,深入研究管理人员在肝脏之中发掘出了一个女同病态恋特异病态的六激酶HKDC1的eQTL,它阻碍生孩子女同病态恋的激素,随后揭示在的族的出世体形上。

因此,通过将GTEx数据的同病态恋意识深入研究与蛋白质功能和核糖体突变结合编者相合组,深入研究管理人员描述了引致生命核糖体第三组和eQTLs同病态恋相异的有第三组织特异病态和有第三组织透过者的飞轮环境因素和有助于。

深入研究管理人员发掘出了多个同病态恋相异的蛋白质表达物理现象,这些物理现象与复杂的变异基因相似之处共轭,从而倡导了GWAS讯号的分子结构解释。

由于许多遗传的致病有第三组织是难以确定的,因此对专业化的GTEx有第三组织收集的深入研究可以作为调查同病态恋偏倚变异坚实的强大教育资源。这项工作对生命核糖体第三组的同病态恋相异及其基因转录顺利进行了相当多的密切相关。

原始记事:

Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066

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